本所成立於民國68年，招收碩士班研究生，於民國71年開始招收博士班研究生。本校奉准於民國86年8月1日更名為「台灣科技大學」，遂調整組織架構，設有五個學院：工程學院、電資學院、管理學院、設計學院及人文社會學院，而工程技術研究所隸屬於工程學院。民國97年3月教育部核准成立「精誠榮譽學院」，將「工程技術研究所」與「全校不分系」學士班業務納入。於民國100年8月1日起本所更名為「應用科技研究所」。104年2月「精誠榮譽學院」更名為「應用科技學院」。 

 

本所重視基礎科學、教育、及應用科技研究，以培育具備能源及材料科技、醫學工程、色彩與影像科技、科教與數位學習之科技人才。本所目前有專任教師共11名、專案教師10名。其中外籍教師有4名。應科所編制內教師之研究領域分別為奈米與醫療工程材料、能源與環境科技、半導體材料與量測科技、能源政策、應用物理與化學及科學教育與數位學習。學生招生組別如下：

組別	領域	招收類別
甲一	先進光源應用科技領域	碩/博士
甲二	薄膜科學與技術領域師資	碩/博士
乙	醫學工程	博士
丙	科學教育及數位學習	碩/博士
丁一	智慧財產權	博士
戊	色彩與影像科技	博士
己一	能源及材料科技 (奈米與醫療工程材料、能源與環境科技、半導體材料與量測科技、能源政策、應用物理與化學。)	碩/博士